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Riserva naturale Cugnoli Curti
Il biotopo di Cugnoli Curti fa parte dell'Inventario federale delle paludi d'importanza nazionale (Ufficio federale dell'ambiente UFAM, oggetto 2312). La zona principale, costituita da due grandi stagni, da boschi palustri e praterie a piccole carici è gestito da Pro Natura che ne intende promuovere la qualità e le funzionalità ecologiche tramite un piano di gestione da attuare in collaborazione con l'Ufficio della Natura e del Paesaggio e con il Parco del Piano di Magadino.
Riserva naturale Biotopo AlpTransit Pasquerio - Pollegio
Situato a Pollegio, questo ambiente naturale è stato ristrutturato a partire da elementi pre-esistenti. In quest'area sono infatti sempre esistiti importanti ambienti umidi e stagni che hanno però subito costanti riduzioni di superficie, prima da parte della costruzione dell'autostrada ed in seguito da parte della linea ferroviaria veloce.
Riserva naturale Biotopo AlpTransit Froda - Biasca
Situato a sud di Biasca e lontano dall'area abitata, questo è uno degli stagni AlpTransit più isolati. Esso presenta una vegetazione di prato magro e arbustiva e uno stagno in falda.
Riserva naturale Biotopo AlpTransit Gaïsc - Bodio
Il biotopo di Gaìsc è posizionato proprio sopra il portale sud della galleria ferroviaria di base. Costruito da Alp Transit come misura di compensazione ecologica del nuovo tracciato ferroviario, questo biotopo è composto da arbusteti, zone di prato secco e uno stagno.
Progetto Nuova vita ai canneti del Ceresio
L'Associazione fondali puliti Ceresio (ASFOPUCE) ha realizzato nel 2007 un canneto artificiale presso Melide con un sostegno anche da parte di Pro Natura Ticino.
Progetto La biodiversità viaggia lungo le strade
Schede pratiche di aiuto all'esecuzione
Per una manutenzione delle aree verdi stradali orientata alla promozione della biodiversità
Progetto Le cicale del Ticino
Le cicale ebbero un ruolo importante già nella mitologia dell'Antica Grecia, e oggi il canto delle "cigales" è uno dei simboli più caratteristici della Francia meridionale. In Svizzera invece, fino a pochi anni fa, la distribuzione sul territorio delle cicale era pressoché sconosciuta. Le cicale sono così il gruppo faunistico, attivo acusticamente e udibile dall'uomo, meno conosciuto (al contrario di anfibi, cavallette e grilli, uccelli, mammiferi). Solo il Vallese ha, dal 2004, un inventario. Per il Ticino non esisteva nessuna registrazione sistematica e neppure le poche segnalazioni di specie erano attendibili. Questo malgrado il fatto che la presenza delle specie europee a distribuzione mediterranea, in Svizzera, abbia il suo fulcro nei Cantoni Ticino e Vallese. 
Progetto Baccante
La Baccante è una farfalla di media grandezza e colore generalmente scuro, passa facilmente inosservata nella penombra del sottobosco.
Progetto Certificazione dei "Giardini naturali"
Hai un giardino dove lasci o vuoi lasciare spazio alla natura? Vorresti che la gente capisca perché non tagli l'erba per far sbocciare i fiori selvatici o perché lasci un cumulo di rami in un angolo? Allora la certificazione fa al caso tuo! Scopri su questa pagina di cosa si tratta.
Progetto Progetto riccio
Fino al 2026 sarà attivo un sito sul quale è possibile segnalare le osservazioni di ricci. I sito permetterà di raccogliere dati sulla presenza del riccio al sud delle Alpi (Ticino e Grigioni italiano) che in seguito serviranno per attuare dei progetti di protezione attiva sul territorio.